Reduced-representation NGS methods in phylogenomics and biogeography: RADseq & RNAseq
Veranstaltungstyp: Blockveranstaltung
Beschreibung: Reduced-representation methods allow genome wide detection of genetic markers without sequencing the whole genome. Restriction-digest methods (RADseq, GBS), RNAseq, Chloroplast sequencing and amplicon sequencing are the most common reduced-representation methods. We will analyze a RADseq dataset using the python-based program pyRAD and we will use this dataset and a RNAseq dataset for phylogenetic reconstruction and compare the results with phylogenetic studies based on Sanger sequencing. Case studies of all four groups of methods will be discussed.
Ort: nicht angegeben
Semester: WiSe 2018/19
Zeiten: Termine am Montag, 01.10.2018 - Dienstag, 02.10.2018, Donnerstag, 04.10.2018 (ganztägig)
Erster Termin: Montag, 01.10.2018 (ganztägig)
Veranstaltungsnummer: 340300
TeilnehmerInnen: Target group: GGNB and GAUSS doctoral students.
Lernorganisation: The course will be held at the Albrecht von Haller Institute, Seminar room 1.213. The Course is a 3-day course held on 1., 2. and 4. October 2018.
Bereichseinordnung: Vorlesungsverzeichnis WiSe 2018/2019 > Forschungseinrichtungen > Göttinger Graduiertenschulen > Georg-August University School of Science (GAUSS) > Göttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften und molekulare Biowissenschaften (GGNB) > Methods Courses > Biophysics, Bioinformatics and Statistics
ECTS-Kreditpunkte:1.5
Weitere Informationen aus Stud.IP zu dieser Veranstaltung
Heimatinstitut: Göttinger Graduiertenzentrum für Neurowissenschaften, Biophysik und molekulare Biowissenschaften (GGNB)
beteiligte Institute: Georg-August University School of Science (GAUSS) (für Mathematik und Naturwissenschaften)
In Stud.IP angemeldete Teilnehmer: 2
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