Vorlesung: Biomolecular Physics and Simulations (Online) - Details

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Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname Vorlesung: Biomolecular Physics and Simulations (Online)
Untertitel
Veranstaltungsnummer 340204
Semester SoSe 2020
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden 4
maximale Teilnehmendenanzahl 30
Heimat-Einrichtung Göttinger Graduiertenzentrum für Neurowissenschaften, Biophysik und molekulare Biowissenschaften (GGNB)
Veranstaltungstyp Vorlesung in der Kategorie Lehre
Erster Termin Montag, 20.04.2020 16:00 - 17:30
Art/Form
Teilnehmende Target group: GGNB and GAUSS doctoral students.
Lernorganisation Lecture "Theoretical and Computational Biophysics" (A 143) is recommended but not prerequisite.

Time: Mondays (during summer semester), 16:00-17:30h.

Organisatorial details: The course will alternate between two rooms in the Physics Faculty: Lectures take place in a lecture hall and the hands-on computer tutorial takes place in a computer/seminar room, Friedrich-Hund-Platz 1, 37077 Göttingen. The room numbers will be announced in due time. An account to access the CIP-Pool Computers of the Physics Faculty is required: Please contact the administrator <support@cip.physik.uni-goettingen.de> in advance.
ECTS-Punkte 2.0

Räume und Zeiten

Keine Raumangabe
Montag: 16:00 - 17:30, wöchentlich(11x)

Kommentar/Beschreibung

IMPORTANT:

To conduct the hands-on computer tutorial, you need access to the CIP Pool computers at the Physics faculty. Usually only students of the Physics faculty automatically get such an account. A GWDG account or an account of a different faculty is not sufficient. If you do not possess such an account yet, please contact the local CIP Pool administrator office in room C.00.101 or write an e-mail to support@cip.physik.uni-goettingen.de.


This combined lecture and hands-on computer tutorial is the continuation of the lecture "Theoretical and Computational Biophysics" (usually taking place in the previous winter term) and offers the possibility to deepen the knowledge about theory and computer simulations of biomolecular systems, particularly proteins. During the exercises, the knowledge presented in the lecture is applied to practical examples to further deepen and strengthen the understanding. By completing homework sets, which are distributed after each lecture, additional aspects of the addressed topics during the lecture shall be worked out. The homework sets are collected during the corresponding exercises.

 

Whereas the lecture "Theoretical and Computational Biophysics" emphasized the principles of running and analyzing simple atomistic force field-based simulations, this advanced course will broaden our view and introduce concepts and methods particularly required to understand biomolecular function, namely thermodynamic quantities such as free energies and affinities. Further, inclusion of quantum mechanical simulation techniques will allow to also simulate chemical reactions, e.g., in enzymes.

 

The following topics will be introduced and further discussed:  Quantum mechanical methods, Hartree-Fock and Density Functional Theory, Rate Theory, Non-equilibrium thermodynamics, Charge transfer and photosynthesis, Free energy calculations.

Anmelderegeln

Diese Veranstaltung gehört zum Anmeldeset "GGNB_Methods_2020_SoSe_February_April".
You can register and sign out for courses in April from 1-20 February. The slots will be assigned around 25 February.
In exceptional circumstances, you can still sign out before 29 February.
Your participation becomes binding on 1 March. Thereafter, cancellation is only possible with a) sick certificate, or b) statement by supervisor. If you do not provide this, you will be banned from courses for the current and next semester, as well as travel grants and other financial support.
By signing up you agree to frequently check your student e-mail account, as all information on courses will exclusively be sent to that account.
Folgende Regeln gelten für die Anmeldung:
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Abschluss ist Promotionsprogramm
    • Abschluss ist Promotionsstudiengang
    • Abschluss ist PromProgramm Cotutelle
    • Abschluss ist Promotion m.Abschlussprfg
  • Die Anmeldung ist möglich von 01.02.2020, 00:00 bis 20.02.2020, 23:59.
  • Mindestens eine der folgenden Bedingungen muss zur Anmeldung erfüllt sein:
    • Studienfach ist PhysicsBiologComplexSyste
    • Studienfach ist Geography
    • Studienfach ist Mathematical Sciences
    • Studienfach ist Geographie
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist Biomol:Struc-Func-Dynamic
    • Studienfach ist Chemie
    • Studienfach ist Emerging Infect. Diseases
    • Studienfach ist Microbiology-Biochemistry
    • Studienfach ist Geoscience
    • Studienfach ist Molekulare Biologie
    • Studienfach ist Environmental Informatics
    • Studienfach ist Behavior and Cognition
    • Studienfach ist Biologische Diversität und Ökologie
    • Studienfach ist Genome Science
    • Studienfach ist Theoret Computat Neurosci
    • Studienfach ist Genes in Development, Disease and Evolution
    • Studienfach ist Catalysis Sust.Synt.CaSuS
    • Studienfach ist Neurowissenschaften
    • Studienfach ist IRTG 2172 - PRoTECT
    • Studienfach ist Physik
    • Studienfach ist Umweltinformatik
    • Studienfach ist Molekulare Medizin
    • Studienfach ist Systems Neuroscience
    • Studienfach ist MolecularBiology of Cells
    • Studienfach ist MetalSites i.Biomolecules
    • Studienfach ist Computer Science -PCS-
    • Studienfach ist SensoryMotor Neuroscience
    • Studienfach ist BioNutz-MolwissBiotechnol
    • Studienfach ist Materialforschung Holz
    • Studienfach ist Biologie
    • Studienfach ist MolecularPhysi oftheBrain
  • Es wird eine festgelegte Anzahl von Plätzen in den Veranstaltungen verteilt.
    Die Plätze in den betreffenden Veranstaltungen wurden am 29.02.2020 um 23:59 verteilt. Weitere Plätze werden evtl. über Wartelisten zur Verfügung gestellt.
  • Die Anmeldung zu maximal 2 Veranstaltungen des Anmeldesets ist erlaubt.
Veranstaltungszuordnung:

Anmeldemodus

Die Anmeldung ist verbindlich, Teilnehmende können sich nicht selbst austragen.